Управление Учебным центром осуществляется в соответствии с действующим законодательством Российской Федерации и Уставом Учреждения. Единоличным исполнительным органом Учебного центра является директор, назначаемый учредителем. Директору подчинены все работники Учебного центра.

Для обеспечения коллегиальности при решении вопросов учебно-методической работы в Учебном центре действует общее собрание работников Учреждения и Педагогический совет. Педагогический совет создан в целях совершенствования организации образовательного процесса, повышения качества обучения, а также профессионального уровня педагогических работников. Полномочия директора и коллегиальных органов управления разграничиваются согласно уставу и локальным нормативным актам Учебного центра.